Tecnologia

Como o financiamento coletivo e a pesquisa de código aberto vão combater o câncer

Isaac Yonemoto Projeto Marilyn pesquisa sobre câncer

Fonte: Indysci.org

O que uma abordagem de pesquisa de código aberto significa para o câncer? Como o financiamento coletivo ajudará a desenvolver medicamentos melhores com mais rapidez? Como tornar os dados de um projeto de pesquisa acessíveis a qualquer pessoa abrirá novos caminhos para pesquisa e inovação? Um químico que escreve software desde a infância quer descobrir.

Um pesquisador chamado Isaac Yonemoto está aplicando alguns dos conceitos de iniciativas de software de código aberto à pesquisa do câncer. Yonemoto está empreendendo Projeto Marilyn , uma campanha para desenvolver um medicamento anticâncer sem patente. O projeto ressuscita a pesquisa de um composto anticâncer chamado 9-desoxisibiromicina , or9DS, que se mostrou eficaz contra vários tipos de câncer em testes iniciais. O Projeto Marilyn também busca mudar a forma como os medicamentos são pesquisados ​​e liberados. O proposta de projeto explica:



“O objetivo social é demonstrar que a pesquisa farmacêutica aplicada pode ser financiada pelo modelo de crowdfunding e que os resultados podem ser divulgados ao domínio público, sem patente. Em última análise, o objetivo do objetivo social é incentivar os fabricantes a produzir medicamentos de forma barata, melhorando o acesso a esses medicamentos. ”

A sibiromicina, o composto original de 9DS, foi originalmente pesquisada na década de 1970 por cientistas siberianos que pensaram que ela tinha potencial para o tratamento do câncer. “É um composto tóxico produzido por bactérias do solo e funciona impedindo a replicação do DNA. Portanto, tem potencial como um quimioterápico anticâncer, ” explica a proposta do Projeto Marilyn. No entanto, eles descobriram que era cardiotóxico, causando estresse ao coração, e pararam de pesquisar. O Projeto 9DS foi desenvolvido por Barbara Gerratana na Universidade de Maryland, College Park, quando ela desenvolveu um método para produzir análogos da sibiromicina sem um átomo de oxigênio que se pensava causar a cardiotoxicidade. A remoção da molécula de oxigênio eliminou os efeitos colaterais e, na verdade, tornou a droga mais eficaz.

Gerratana então conseguiu um emprego no Instituto Nacional de Saúde e não pôde continuar a pesquisa. Era improvável que as empresas farmacêuticas patrocinassem a pesquisa porque ela já havia publicado seus resultados sem uma patente. Mas, como o trabalho não foi patenteado, agora está em domínio público. É aí que entra Yonemoto. “Por que fazer drogas sem patentes?” o site Indysci.org pergunta.

“Quando Salk e Sabin curaram a poliomielite, eles não patentearam a vacina. É hora de desenvolver um medicamento anticâncer sem patente para o século 21. Como a indústria farmacêutica hoje, a indústria de software foi historicamente dominada por grandes empresas e bases de códigos proprietários. Hoje, o sistema operacional mais usado no planeta - Android - é de código aberto. Qualquer pessoa pode copiar e personalizar o código para atender a necessidades específicas ou melhorar a base do código para toda a comunidade. Conforme você explora a web, você verá conteúdo e serviços fornecidos ou possibilitados por projetos de código aberto como Linux, Wikipedia, WordPress, etc. ”

Espera-se que o Projeto 9DS seja eficaz contra melanoma, câncer renal e câncer de mama triplo negativo. Com pequenas mudanças na molécula, o composto também pode ser eficaz contra mais tipos de câncer. O projeto até agora recebeu promessas de quase $ 15.000 de sua meta de $ 50.000, mais quase $ 2.800 em Bitcoin; $ 50.000 irão financiar o projeto por cerca de seis meses. Durante esse tempo, Yonemoto planeja produzir mais 9DS e submeter o composto a um estudo de xenoenxerto para medir a eficácia da droga contra certas linhas de câncer (que assumirá a forma de 'cura do câncer em camundongos', como explica o site) .

“Esta é a próxima etapa no desenvolvimento de medicamentos e uma etapa importante no caminho para a realização de estudos clínicos (humanos)”, observa Yonemoto. “Se recebermos mais financiamento, adicionaremos objetivos extensos, como mais experimentos pré-clínicos em 9DS, desenvolvimento de análogos de 9DS ou outras ideias anti-câncer empolgantes”. O projeto liderado por Yonemoto e Evan Powers, o co-inventor da droga Tafamidis, fornecerá uma revisão independente de seus esforços. Com fio aprendi que Yonemoto pretende publicar os dados do Projeto Marilyn abertamente, possivelmente no GitHub, onde os desenvolvedores hospedam rotineiramente projetos de software de código aberto.

Wired’s Robert McMillan também observa que as táticas de arrecadação de fundos de Yonemoto vão contra o método padrão de pesquisa de drogas, mas representam um retorno aos métodos de pesquisa de drogas de meados do século, como a vacina contra poliomielite, que foi desenvolvida e distribuída sem as restrições de patentes. Yonemoto disse a McMillan que “a biologia está se tornando mais como uma disciplina de ciência da computação”, com a transição acelerada por avanços tecnológicos como o sequenciamento computadorizado do genoma humano.

Embora a tecnologia para sequenciar um genoma humano inteiro só exista por cerca de 15 anos, o forte vínculo que ela estabeleceu entre a ciência da computação e a biologia tornou cada vez mais possível para os pesquisadores abordarem projetos de pesquisa médica da mesma forma que os desenvolvedores lidariam com o processo de projetar um grande sistema de software. O cofundador do Google, Sergey Brin, é famoso por considerar uma mutação em seus próprios genes um bug em seu código pessoal, e a ideia de alavancar as proezas computacionais do Google para impulsionar a pesquisa médica está por trás da própria pesquisa do Google, como o Estudo de Base do Google X, e seu apoio de outros empreendimentos como Calico, que pesquisa envelhecimento, doenças neurodegenerativas e câncer.

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Explorando a genética como fariam com o código-fonte, os pesquisadores também estão aproveitando o baixo custo de coisas como o sequenciamento de um genoma humano inteiro, que agora custa cerca de US $ 1.000 , como Francis de Souza, presidente da Illumina, fabricante de máquinas de sequenciamento de DNA, explicou no MIT Revisão de tecnologia Conferência EmTech. Ele estimou que 228.000 genomas humanos serão sequenciados este ano por pesquisadores de todo o mundo, e que o sequenciamento é frequentemente usado para orientar o tratamento de vários tipos de câncer. A Illumina acredita que o mercado de estudos de DNA em alta velocidade pode chegar a US $ 20 bilhões por ano, com metade disso ligado ao estudo de doenças como melanoma, câncer de pulmão ou tumores cerebrais.

GeneHub é uma startup de São Francisco que lançou e depois cancelou um Campanha Kickstarter para financiar coletivamente o lançamento de um serviço para oferecer o sequenciamento do genoma completo a indivíduos. (A campanha foi cancelada devido a marcas registradas detidas por outra empresa de genômica que exigirá a reformulação da marca GeneHub.) A startup ainda pretende oferecer o primeiro serviço de sequenciamento de genoma disponível para qualquer pessoa e explica suas motivações:

“Nos 11 anos desde que o Projeto Genoma Humano foi concluído, as instituições acadêmicas fizeram pouco progresso no entendimento da incrível variedade expressa no genoma das pessoas. Mal entendemos como seus genes fazem você, você. Este problema não será resolvido em um laboratório com a falta de compartilhamento de dados e mentalidade fechada de 'publicar ou perecer', mas dando a você e a outras pessoas brilhantes por aí acesso ao seu próprio genoma e capacitando você a explorar, compartilhar, analisar, e controlar seu próprio genoma. “

Embora o GeneHub espere construir um negócio oferecendo o sequenciamento do genoma como um serviço, suas aspirações também estão alinhadas com as aspirações de Yonemoto de tornar os dados médicos mais acessíveis e abertos à pesquisa por uma variedade de pessoas. Da mesma forma que os desenvolvedores tornam seus softwares de código aberto na esperança de que outros possam levar seus recursos ainda mais longe, e em novas direções, tornar a pesquisa médica e genética de código aberto ou amplamente disponível pode levar a descobertas importantes para pesquisadores que lutam contra o câncer e outras doenças. .

Mas isso não antes que esta intersecção única de biologia e ciência da computação supere alguns desafios. Um deles é um problema de imagem: a percepção de que os projetos de saúde com financiamento coletivo estão contornando o processo tradicional de revisão por pares que dá crédito às afirmações científicas. O Projeto de imunidade, o rastreador de atividades GoBe e o Scout Scanadu emprestaram alguma validade a esse receio. Enquanto as startups buscam democratizar as informações e pesquisas médicas, será fundamental para elas poderem provar suas hipóteses e demonstrar o potencial de seus medicamentos ou tecnologia.

Também é possível que os projetos de pesquisa de código aberto também precisem encontrar uma maneira de arrecadar mais dinheiro do que por meio de crowdfunding, uma vez que são necessárias grandes somas para desenvolver e produzir um medicamento. Se bem executadas, iniciativas como o Projeto Marilyn servem não apenas para demonstrar a validade científica de um medicamento ou tratamento, mas podem atrair mais pesquisadores e investidores para o projeto. Isso poderia dar início a novas áreas de pesquisa promissoras e, possivelmente, encurtar o processo notoriamente longo de desenvolvimento e teste de novos medicamentos e tratamentos - o que significa que quando Yonemoto ou outro pesquisador finalizar o próximo medicamento anticâncer importante, eles poderão levar essa inovação do laboratório para a realidade -vida pacientes um pouco mais rápido.

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